Protein–RNA interactions for Protein: P08883

Gzmf, Granzyme F, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmfP08883 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GzmfP08883 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GzmfP08883 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GzmfP08883 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GzmfP08883 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GzmfP08883 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GzmfP08883 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GzmfP08883 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GzmfP08883 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GzmfP08883 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GzmfP08883 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms