Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd4P06332 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd4P06332 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd4P06332 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd4P06332 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd4P06332 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms