Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CrygdP04342 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CrygdP04342 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CrygdP04342 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrygdP04342 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrygdP04342 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms