Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc1P02468 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lamc1P02468 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lamc1P02468 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Lamc1P02468 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms