Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-AaP01910 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-AaP01910 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms