Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01654 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01654 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01654 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01654 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01654 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01654 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01654 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01654 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01654 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01654 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01654 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01654 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01654 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01654 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01654 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01654 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01654 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01654 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01654 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01654 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01654 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01654 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01654 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01654 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01654 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01654 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01654 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01654 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01654 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01654 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01654 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01654 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01654 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01654 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01654 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01654 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01654 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01654 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01654 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01654 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01654 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
P01654 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01654 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01654 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01654 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01654 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01654 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01654 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01654 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01654 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01654 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01654 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01654 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01654 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01654 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01654 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01654 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01654 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01654 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01654 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01654 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01654 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01654 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01654 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01654 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01654 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms