Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosP01101 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosP01101 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosP01101 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosP01101 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FosP01101 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosP01101 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FosP01101 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FosP01101 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FosP01101 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FosP01101 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosP01101 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosP01101 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FosP01101 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosP01101 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosP01101 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosP01101 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosP01101 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosP01101 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosP01101 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosP01101 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FosP01101 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FosP01101 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FosP01101 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FosP01101 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FosP01101 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FosP01101 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosP01101 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosP01101 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosP01101 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosP01101 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosP01101 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosP01101 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosP01101 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosP01101 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosP01101 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosP01101 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FosP01101 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FosP01101 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FosP01101 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FosP01101 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FosP01101 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FosP01101 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FosP01101 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FosP01101 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FosP01101 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FosP01101 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FosP01101 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FosP01101 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FosP01101 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FosP01101 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FosP01101 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FosP01101 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FosP01101 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FosP01101 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FosP01101 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FosP01101 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FosP01101 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FosP01101 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FosP01101 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FosP01101 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FosP01101 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FosP01101 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FosP01101 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FosP01101 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FosP01101 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FosP01101 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms