Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShdO88834 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ShdO88834 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ShdO88834 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ShdO88834 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ShdO88834 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ShdO88834 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ShdO88834 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ShdO88834 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ShdO88834 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ShdO88834 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ShdO88834 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ShdO88834 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ShdO88834 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ShdO88834 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ShdO88834 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ShdO88834 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ShdO88834 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ShdO88834 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ShdO88834 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ShdO88834 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ShdO88834 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ShdO88834 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ShdO88834 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShdO88834 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShdO88834 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ShdO88834 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ShdO88834 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ShdO88834 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ShdO88834 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ShdO88834 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ShdO88834 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ShdO88834 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ShdO88834 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ShdO88834 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ShdO88834 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ShdO88834 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ShdO88834 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ShdO88834 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ShdO88834 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ShdO88834 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ShdO88834 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ShdO88834 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ShdO88834 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ShdO88834 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ShdO88834 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ShdO88834 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ShdO88834 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ShdO88834 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ShdO88834 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ShdO88834 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ShdO88834 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ShdO88834 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ShdO88834 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ShdO88834 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ShdO88834 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ShdO88834 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ShdO88834 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms