Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Orc4O88708 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Orc4O88708 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Orc4O88708 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Orc4O88708 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Orc4O88708 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Orc4O88708 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Orc4O88708 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Orc4O88708 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms