Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn2O88552 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn2O88552 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn2O88552 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn2O88552 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn2O88552 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms