Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh16O88338 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh16O88338 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh16O88338 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh16O88338 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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