Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad51dO55230 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad51dO55230 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms