Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlx3O55144 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlx3O55144 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlx3O55144 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlx3O55144 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms