Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd200O54901 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200O54901 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200O54901 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd200O54901 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200O54901 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200O54901 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd200O54901 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd200O54901 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200O54901 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd200O54901 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd200O54901 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd200O54901 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd200O54901 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd200O54901 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms