Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3d1O54774 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ap3d1O54774 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3d1O54774 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3d1O54774 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms