Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp15O54732 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp15O54732 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp15O54732 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp15O54732 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms