Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nthl1O35980 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nthl1O35980 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nthl1O35980 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nthl1O35980 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nthl1O35980 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms