Protein–RNA interactions for Protein: O35681

Syt3, Synaptotagmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt3O35681 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt3O35681 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt3O35681 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt3O35681 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt3O35681 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt3O35681 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt3O35681 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt3O35681 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt3O35681 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt3O35681 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt3O35681 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Syt3O35681 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Syt3O35681 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt3O35681 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt3O35681 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt3O35681 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt3O35681 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt3O35681 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt3O35681 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt3O35681 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt3O35681 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 428.1 ms