Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KeraO35367 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KeraO35367 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KeraO35367 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KeraO35367 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KeraO35367 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KeraO35367 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KeraO35367 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KeraO35367 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KeraO35367 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KeraO35367 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KeraO35367 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KeraO35367 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KeraO35367 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KeraO35367 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KeraO35367 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KeraO35367 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KeraO35367 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KeraO35367 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KeraO35367 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KeraO35367 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KeraO35367 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KeraO35367 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KeraO35367 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KeraO35367 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KeraO35367 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KeraO35367 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KeraO35367 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KeraO35367 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KeraO35367 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KeraO35367 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KeraO35367 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KeraO35367 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KeraO35367 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KeraO35367 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KeraO35367 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KeraO35367 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KeraO35367 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KeraO35367 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KeraO35367 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KeraO35367 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KeraO35367 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KeraO35367 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KeraO35367 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KeraO35367 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KeraO35367 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KeraO35367 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KeraO35367 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KeraO35367 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KeraO35367 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KeraO35367 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KeraO35367 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KeraO35367 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms