Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd9O35177 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd9O35177 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nedd9O35177 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms