Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltbp2O08999 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltbp2O08999 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ltbp2O08999 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ltbp2O08999 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms