Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm8271L7N2E2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm8271L7N2E2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm8271L7N2E2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm8271L7N2E2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm8271L7N2E2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm8271L7N2E2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms