Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4dL7N216 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4dL7N216 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4dL7N216 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4dL7N216 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4dL7N216 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer4dL7N216 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer4dL7N216 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms