Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3542K7N6U2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3542K7N6U2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3542K7N6U2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms