Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc191J3QQ27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc191J3QQ27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc191J3QQ27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms