Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21976J3QNN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21976J3QNN2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21976J3QNN2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21976J3QNN2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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