Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930544D05RikJ3QK56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930544D05RikJ3QK56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930544D05RikJ3QK56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms