Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab11fip2G3XA57 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab11fip2G3XA57 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab11fip2G3XA57 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab11fip2G3XA57 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip2G3XA57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip2G3XA57 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip2G3XA57 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms