Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12bG3X9I7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h12bG3X9I7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12bG3X9I7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms