Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccl26F8VQM2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccl26F8VQM2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccl26F8VQM2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccl26F8VQM2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccl26F8VQM2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms