Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
BicraF8VPZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
BicraF8VPZ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
BicraF8VPZ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
BicraF8VPZ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
BicraF8VPZ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
BicraF8VPZ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
BicraF8VPZ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms