Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ttc37F8VPK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ttc37F8VPK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ttc37F8VPK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ttc37F8VPK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ttc37F8VPK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ttc37F8VPK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 485.8 ms