Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Raph1F2Z3U3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Raph1F2Z3U3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Raph1F2Z3U3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raph1F2Z3U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raph1F2Z3U3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms