Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4E9QAP7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf4E9QAP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms