Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd7E9Q9W7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd7E9Q9W7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd7E9Q9W7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd7E9Q9W7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms