Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh18E9Q9Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh18E9Q9Q6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh18E9Q9Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh18E9Q9Q6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh18E9Q9Q6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms