Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8M1

Zfp358, Zinc finger protein 358, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp358E9Q8M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp358E9Q8M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp358E9Q8M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp358E9Q8M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp358E9Q8M1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp358E9Q8M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp358E9Q8M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms