Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DspE9Q557 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DspE9Q557 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DspE9Q557 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DspE9Q557 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DspE9Q557 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DspE9Q557 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DspE9Q557 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DspE9Q557 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DspE9Q557 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DspE9Q557 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DspE9Q557 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DspE9Q557 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms