Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20518E9Q548 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm20518E9Q548 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms