Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2010300C02RikE9Q3M9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2010300C02RikE9Q3M9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
2010300C02RikE9Q3M9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2010300C02RikE9Q3M9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms