Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r238E9Q373 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r238E9Q373 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r238E9Q373 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r238E9Q373 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms