Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A7

Gm3594, Predicted gene 3594, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3594E9Q2A7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3594E9Q2A7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3594E9Q2A7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3594E9Q2A7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3594E9Q2A7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3594E9Q2A7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms