Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp558E9Q1J0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zfp558E9Q1J0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp558E9Q1J0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp558E9Q1J0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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