Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Atad2bE9Q166 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Atad2bE9Q166 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Atad2bE9Q166 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Atad2bE9Q166 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Atad2bE9Q166 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Atad2bE9Q166 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Atad2bE9Q166 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Atad2bE9Q166 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.3 ms