Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0S6

Tns1, Tensin 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns1E9Q0S6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tns1E9Q0S6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns1E9Q0S6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tns1E9Q0S6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tns1E9Q0S6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms