Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2956E9PVJ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2956E9PVJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2956E9PVJ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm2956E9PVJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms