Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Syde2E9PUP1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syde2E9PUP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syde2E9PUP1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Syde2E9PUP1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syde2E9PUP1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.6 ms