Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl3E0CZ16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl3E0CZ16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl3E0CZ16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms