Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms