Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10110D3Z5M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10110D3Z5M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10110D3Z5M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10110D3Z5M2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms