Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfbr3lD3YZZ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms